Na região de Kalos, uma velha lenda falava de dois Pokémons lendários, Xerneas e Yveltal, que apareciam a cada 1000 anos para entrar em confronto. O mito tornou-se realidade quando os dois surgiram em Vila Vaniville num dia, causando destruição por toda a área. Com suas casas arrasadas, X, um prodígio em batalhas que se isolou após um incidente envolvendo paparazzi, foi forçado a embarcar em uma jornada com seus amigos de infância: Y, um Treinador do Céu em treinamento; Trevor, aspirante a estudioso; Tierno, especialista em dança; e Shauna, que sonhava em se tornar uma Estilista de Furfrou. Sob a constante ameaça da sombria Equipe Flare, que cobiçava o misterioso Mega Anel de X, os cinco jovens treinadores precisam permanecer unidos e confiar uns nos outros para enfrentar cada desafio e descobrir o que encontrarem, incluindo a resposta para o mistério da Mega Evolução...

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